Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CELF6Q96J87 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CELF6Q96J87 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms