Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms