Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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LRRC39Q96DD0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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LRRC39Q96DD0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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LRRC39Q96DD0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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LRRC39Q96DD0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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LRRC39Q96DD0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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LRRC39Q96DD0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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LRRC39Q96DD0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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LRRC39Q96DD0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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