Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPRTQ96BW1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms