Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms