Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF3C6Q969F1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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GTF3C6Q969F1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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GTF3C6Q969F1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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GTF3C6Q969F1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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GTF3C6Q969F1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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GTF3C6Q969F1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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GTF3C6Q969F1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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