Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR2Q969E8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms