Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD50Q92878 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms