Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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RABGGTAQ92696 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RABGGTAQ92696 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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