Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3AQ92664 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3AQ92664 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms