Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN4Q92575 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms