Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTTNBP2Q8WZ74 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms