Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
TRIM41Q8WV44 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms