Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29Q8TEQ0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms