Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE23Q8NDY6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms