Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC155Q8N6L0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms