Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN19Q8N6F1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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