Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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TMTC2Q8N394 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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