Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU1Q7Z7A3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTU1Q7Z7A3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTU1Q7Z7A3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTU1Q7Z7A3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms