Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms