Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
STRCQ7RTU9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRCQ7RTU9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms