Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMUB2Q71RG4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms