Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD6Q6ZV73 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD6Q6ZV73 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms