Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPGS1Q6ZTW0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms