Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB5

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZNB5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6ZNB5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6ZNB5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms