Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms