Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms