Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAAP20Q6NZ36 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms