Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT80Q6KB66 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms