Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTP1Q6DN14 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms