Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSBN1Q5VWQ0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms