Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC01545Q5VT33 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms