Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PRICKLE1-215ENST00000640055 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms