Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q5VSD8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q5VSD8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms