Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39AQ5SRH9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms