Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PHYHD1Q5SRE7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHYHD1Q5SRE7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms