Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM74A1Q5RGS3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms