Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms