Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms