Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms