Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4orf17Q53FE4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms