Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY2Q49AN0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY2Q49AN0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms