Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms