Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRFIP1Q32MZ4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms