Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPHKAPQ2M3C7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPHKAPQ2M3C7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms