Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX7Q2KHR2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms