Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q1T7F1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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