Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMA3Q16787 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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