Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLPPQ16740 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms