Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CARTPTQ16568 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms